城鎮(zhèn)醫(yī)療和農(nóng)村合作醫(yī)療的區(qū)別為：

1.參保人不同，城鎮(zhèn)醫(yī)療（即職工醫(yī)保）是由職工參保，保費由用人單位和職工共同繳納，而農(nóng)村合作醫(yī)療（即新農(nóng)合）主要由農(nóng)民朋友們參保，是一種互助共濟(jì)的醫(yī)療制度，也屬于國家醫(yī)保；

2.城鎮(zhèn)醫(yī)療所需要繳納的保費相對于農(nóng)村合作醫(yī)療來說要高一些；

3.城鎮(zhèn)醫(yī)療所能報銷的費用相對于農(nóng)村合作醫(yī)療來說要高一些；

4.農(nóng)村合作醫(yī)療的起付線相對于城鎮(zhèn)醫(yī)療來說要低一些。